23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  367  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  52.87 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  44.79 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  43.36 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  40.14 
 
 		 379 aa  95.5  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  40.85 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  34.87 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  37.84 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  36.17 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  29.17 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  32.64 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  38.42 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  32.75 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  38.46 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  32.45 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  31.87 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  29.53 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  29.53 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  29.53 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  40.83 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  31.72 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  29.27 
 
 		 119 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>