97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5054 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  100 
 
 
181 aa  346  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  86.74 
 
 
181 aa  278  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  47.93 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  51.03 
 
 
379 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  39.77 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  40.54 
 
 
321 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  40.54 
 
 
321 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  40.54 
 
 
321 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  38.67 
 
 
276 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  39.16 
 
 
315 aa  104  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  40 
 
 
271 aa  97.4  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  40.14 
 
 
236 aa  94.4  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  36.07 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  42.13 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  41.72 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  37.96 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  35.2 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  37.7 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  36.52 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  42.22 
 
 
149 aa  62  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  38.67 
 
 
137 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  38.16 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  41.33 
 
 
137 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  33.33 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  41.67 
 
 
137 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  41.67 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  35.71 
 
 
137 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  40.28 
 
 
137 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  38.29 
 
 
192 aa  58.2  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  34.75 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  38.16 
 
 
136 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  35.53 
 
 
136 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  37.23 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  36 
 
 
136 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  32.6 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  30.56 
 
 
150 aa  54.7  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  39.73 
 
 
143 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  43.08 
 
 
152 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  42.37 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  42.37 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  45 
 
 
136 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  36.44 
 
 
130 aa  51.2  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  40.74 
 
 
136 aa  51.2  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  35.62 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  46.27 
 
 
134 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  37.5 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  35.33 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  40.68 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  36 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  38.46 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  38.81 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  47.37 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  40.3 
 
 
139 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  32.87 
 
 
142 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  36.99 
 
 
137 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  36.99 
 
 
137 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  36.84 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  43.28 
 
 
139 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  36.84 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  35.53 
 
 
136 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  34.78 
 
 
139 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  43.24 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  36.84 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  36.84 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  31.85 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  29.45 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  29.71 
 
 
152 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  37.04 
 
 
145 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  43.33 
 
 
136 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  36.84 
 
 
167 aa  44.3  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  36.84 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  52.38 
 
 
133 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  31.72 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  36.84 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  33.62 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  35.19 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  34.25 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  35.19 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  35.19 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  35.71 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  30.28 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  33.9 
 
 
137 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  33.09 
 
 
135 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  30.37 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  32.82 
 
 
147 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  32.56 
 
 
137 aa  41.6  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4764  DoxX  42.25 
 
 
119 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  32.84 
 
 
140 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  39.29 
 
 
131 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  39.71 
 
 
135 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  29.93 
 
 
150 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  27.78 
 
 
136 aa  40.8  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  37.88 
 
 
131 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  34.72 
 
 
136 aa  40.8  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  37.88 
 
 
131 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  37.88 
 
 
131 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>