51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3403 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  100 
 
 		 276 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  76.17 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  71.73 
 
 		 321 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  71.73 
 
 		 321 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  71.73 
 
 		 321 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  45.05 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  40.85 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  40.97 
 
 		 174 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  38.75 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  34.93 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  38.41 
 
 		 181 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  39.86 
 
 		 176 aa  89.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  39.86 
 
 		 181 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  31.97 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  33.81 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  34.93 
 
 		 182 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  34.43 
 
 		 119 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  41.13 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  32.88 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  32.92 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  30.97 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  33.09 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  42.34 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  35.14 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  32.64 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  29.2 
 
 		 155 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  29.2 
 
 		 137 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  37.68 
 
 		 137 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  33.75 
 
 		 137 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  29.85 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  37.66 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  30.43 
 
 		 145 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  37.5 
 
 		 135 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  32.1 
 
 		 134 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0081  DoxX family protein  35.87 
 
 		 175 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.614954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  28.37 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  32.14 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  32.1 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  28.44 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  34.04 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  31.71 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  34.04 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  30.17 
 
 		 130 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  26.87 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  33.05 
 
 		 136 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  27.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  29.41 
 
 		 145 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  26.67 
 
 		 145 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  28.36 
 
 		 149 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  27.86 
 
 		 136 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>