48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18830 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  97.35 
 
 		 236 aa  407  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  38.16 
 
 		 174 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  34.33 
 
 		 379 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  34.9 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  38.35 
 
 		 182 aa  84.7  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  34.06 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  34.06 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  34.06 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  33.81 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  32.86 
 
 		 315 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  34.59 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  37.84 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  37.16 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  37.5 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  32.26 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  42.39 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  37.96 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  30.87 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  36.49 
 
 		 181 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  32.5 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  32.69 
 
 		 137 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  32.69 
 
 		 137 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  35.14 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  33.81 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  34.07 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  35.09 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  38.57 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  41.03 
 
 		 133 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  38.57 
 
 		 136 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  31.53 
 
 		 136 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  31.43 
 
 		 130 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  32.99 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.99 
 
 		 155 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  30.51 
 
 		 137 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.96 
 
 		 137 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  34.33 
 
 		 136 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  36.36 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  31.73 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  29.92 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  35.48 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  31.58 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.17 
 
 		 137 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  33.85 
 
 		 149 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  36.07 
 
 		 135 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  33.87 
 
 		 139 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  33.87 
 
 		 174 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  30 
 
 		 182 aa  41.6  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>