103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0868 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  100 
 
 		 130 aa  248  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  46.92 
 
 		 379 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  49.07 
 
 		 119 aa  93.2  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  40.46 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  38.46 
 
 		 182 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  37.74 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  38.98 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  36.97 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  35.9 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  32.8 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  37.5 
 
 		 238 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  31.78 
 
 		 321 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  33.05 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  31.78 
 
 		 321 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  31.78 
 
 		 321 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  33.05 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  35.96 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  31.67 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  31.01 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  32.2 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  33.62 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  33.33 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  36.75 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  35.66 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  33.91 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  34.23 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  29.77 
 
 		 315 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  35.43 
 
 		 271 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  32.41 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  37.29 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  38.98 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  30.65 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  36.44 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  31.68 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  32.17 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  29.66 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  33.62 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  35.19 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  30.84 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  35.85 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  31.43 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  29.31 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  32.74 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  34.45 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  34.43 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  31.86 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  30.51 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  29.66 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  31.48 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  29.52 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  29.52 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  29.52 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  34.78 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  32.14 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  38.74 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  32.48 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  30.08 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  34.82 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  31.36 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.91 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  31.36 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  30.63 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  28.71 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  29.31 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  28.83 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  34.68 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  33.03 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  31.62 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  34.43 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  26.23 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  33.93 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  31.75 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  27.21 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  26.55 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  33.03 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  38.2 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11793  hypothetical protein  26.32 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  29.66 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  29.66 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  26.56 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  31.3 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  33.94 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  29.66 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  29.66 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  29.66 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  29.66 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  29.66 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  30.77 
 
 		 142 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  39.68 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  29.63 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  29.63 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  33.61 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  29.63 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  40.32 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  27.61 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  29.63 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>