56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5469 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  69.23 
 
 		 183 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  75.81 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  57.81 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  72.22 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  65.79 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  72.88 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  57.6 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  75 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  48.41 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  51.59 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  46.67 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  49.57 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  42.11 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  45 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  46.22 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  46.9 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  45.24 
 
 		 150 aa  85.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  45.24 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  45.24 
 
 		 150 aa  85.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  42.62 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  40.18 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  35.09 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  33.93 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  33.04 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  31.82 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  31.82 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  31.97 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  35.29 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  36.04 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  28.45 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  24.79 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  32.41 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  32.35 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  28.57 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  29.59 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  29.59 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  27.78 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  26.96 
 
 		 250 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  31.07 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  26.47 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  32.11 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  26.19 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  27.2 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  29.41 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  32.63 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  34 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  26.23 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  30.77 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  30.77 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  26.17 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  30.77 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  28.57 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  28.07 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  27.78 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>