45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5314 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  79.66 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  64.17 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  72.88 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  73.04 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  56.35 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  65 
 
 		 132 aa  121  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  54.29 
 
 		 141 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  57.26 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  42.55 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  52.21 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  39.84 
 
 		 216 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  45.3 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  48.21 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  45.3 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  45.3 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  41.41 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  43.36 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  42.48 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  41.88 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  64.52 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  39.29 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  36.13 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  36.13 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  35.19 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.55 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  30 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  30.63 
 
 		 250 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  30.51 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  28.45 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  36.21 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  31.19 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  31.13 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  34.21 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  36.36 
 
 		 136 aa  43.9  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  31.48 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  31.48 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  32.35 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  36.79 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  33 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  35.85 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  30.25 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  35.85 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  27.87 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  30 
 
 		 145 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>