21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1142 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  43.75 
 
 		 159 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  41.86 
 
 		 137 aa  85.1  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  39.1 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  38.93 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  37.98 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  37.4 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  31.3 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  35.09 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  27.69 
 
 		 146 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  29.09 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  26.89 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  26.89 
 
 		 137 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  25.81 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  30.43 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  26.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  25.98 
 
 		 141 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  31.91 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  28.28 
 
 		 131 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  39.58 
 
 		 137 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  30.36 
 
 		 136 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>