28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0188 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  61.87 
 
 		 148 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  61.15 
 
 		 148 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  57.75 
 
 		 148 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  63.24 
 
 		 151 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  59.29 
 
 		 148 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  61.27 
 
 		 150 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  62.96 
 
 		 150 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  62.96 
 
 		 150 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  58.96 
 
 		 141 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  58.96 
 
 		 141 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  48.15 
 
 		 183 aa  95.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  41.03 
 
 		 147 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  46.02 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  31.3 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  50 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  46.88 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  31.78 
 
 		 159 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  45.83 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  41.28 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  34.51 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  35.4 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  35.77 
 
 		 139 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  34.82 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  32.33 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  24.06 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  37.7 
 
 		 72 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>