74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3971 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  57.04 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  60.33 
 
 		 183 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  55.73 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  58.88 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  51.52 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  50.82 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  42.98 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  45.9 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  41.6 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  39.31 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  38.02 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  37.29 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  40.16 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  40.16 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  40 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  54.17 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  36.07 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  37.29 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  39.81 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  35.9 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  36.45 
 
 		 137 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  36.45 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  37.25 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  41.57 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  41.57 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  41.57 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  41.57 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  33.01 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  33.01 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  33.91 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  34.96 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  30.58 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  30.56 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  32.04 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  35.29 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  35.29 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.63 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  34.74 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  28.35 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  31.68 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  38.24 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  28.68 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  29.2 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  29.41 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  29.2 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  29.2 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  29.2 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  29.2 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  29.2 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  29.2 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  27.56 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  28 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  29.2 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  37.25 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  37.25 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  37.25 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  27.84 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  24.8 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  36.84 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  29.47 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1546  DoxX family protein  34.65 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  23.53 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3227  DoxX family protein  32.84 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  34.65 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  26.36 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  29.41 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3522  DoxX family protein  31.34 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0254213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  33.78 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  33.78 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>