19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1546 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1546  DoxX family protein  100 
 
 		 157 aa  309  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1061  DoxX family protein  63.58 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  0.0497781 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3130  DoxX family protein  56.43 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.767658  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  31.88 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  37.7 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  31.4 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  33.58 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  37.86 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  33.06 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  33.59 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  33.63 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  32.54 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  29.92 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  32 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  32 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  32 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  32 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  32 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>