17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3130 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3130  DoxX family protein  100 
 
 		 154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.767658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1061  DoxX family protein  51.97 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  0.0497781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1546  DoxX family protein  56.43 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  normal  0.0347646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  29.69 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  29.69 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  29.69 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  30.47 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  29.69 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  29.69 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  29.69 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  29.69 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  29.69 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  30.47 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  26.72 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  31.82 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  28.21 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  31.78 
 
 		 143 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>