27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1061 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1061  DoxX family protein  100 
 
 		 160 aa  315  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  0.0497781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1546  DoxX family protein  63.58 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3130  DoxX family protein  51.97 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.767658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  32.54 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  40 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  30.3 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.79 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  32.93 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  31.85 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  30.84 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.97 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  30.95 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  32.71 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  28.93 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.92 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  35.25 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  38.96 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  29.91 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  28.97 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  29.63 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  28.83 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  27.07 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  29.71 
 
 		 129 aa  42  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  31.45 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  28.97 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  30.95 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  30.65 
 
 		 137 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>