204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2385 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  253  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  48.39 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  40.83 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  39.66 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  39.5 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  35.38 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  35.38 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  35.38 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  42.4 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  30.23 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  35.48 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  35.48 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  35.25 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  36.89 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  33.33 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  41.54 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  33.33 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  33.33 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  33.33 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  38.4 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  35.25 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  36.89 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  43.97 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  32.56 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  31.01 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  35.48 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  40.15 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  31.78 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  37.1 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.59 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  36.29 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  33.33 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  39.39 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  37.5 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  39.39 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  39.39 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  39.39 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  35.11 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  38.52 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  39.84 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  45 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  34.23 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  35.78 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  39.02 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  35.16 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  34.17 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  36.84 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  33.64 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  38.33 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  40.83 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  34.55 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  34.96 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  36.13 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  34.35 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  34.35 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  34.35 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  34.35 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  34.35 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  35.38 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  35.38 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  35.38 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  34.35 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  34.35 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  34.43 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  29.13 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  40.32 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  31.82 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  31.82 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  31.5 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  31.82 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  34.58 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  33.59 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  35.38 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  36.61 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  33.94 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1426  DoxD-like family protein  37.7 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.639544  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1877  hypothetical protein  37.7 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2188  DoxD-like family protein  37.7 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39427  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0561  DoxX family membrane protein  37.7 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0464  DoxX family protein  37.7 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.412831  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0873  DoxD-like family protein  37.7 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  32.11 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  33.03 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  33.04 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  40 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  33.04 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  35.78 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  33.63 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  33.03 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  33.04 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  33.63 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  30.77 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  31.3 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  33.85 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>