109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4810 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  100 
 
 		 147 aa  290  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  51.59 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  47.48 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  44.07 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  46.55 
 
 		 183 aa  91.3  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  41.46 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  40.77 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  37.7 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  45.69 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  41.8 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  40.68 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  42.06 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  42.61 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  40.37 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  37.61 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  40.37 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  37.06 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  37.06 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  37.61 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  38.66 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  54.55 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  35.4 
 
 		 216 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  40.3 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  37.5 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  37.7 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  41.96 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  40.56 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  35.09 
 
 		 250 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  33.61 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  34.92 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  36.36 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  43.24 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  35.34 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  36.04 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  35.4 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  29.29 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.54 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  29.29 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  30.17 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  29.05 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  35.65 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  32.26 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  35.19 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  35.19 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  55.17 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  35.19 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  32.43 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  35.19 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  28.57 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  33.62 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  31.33 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  28.99 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  32.76 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  33.05 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  28.93 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  29.93 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  31.97 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  32.76 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  32.76 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  24.79 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  32.76 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  33.93 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  27.78 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  31.03 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  27.78 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  27.78 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  27.78 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  27.78 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  27.78 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  27.78 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  29.81 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  33.05 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  27.12 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  30.08 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  30.63 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  35.85 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  33.63 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  31.5 
 
 		 379 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  32.11 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  30.36 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  32.28 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  29.73 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  39.29 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  28.93 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  28.93 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  29.09 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  26.5 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  33.05 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  31.3 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  31.9 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  32.74 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  28.83 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  30.37 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  27.68 
 
 		 129 aa  42  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  29.46 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  31.5 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1061  DoxX family protein  30.83 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal  0.0497781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3737  DoxX family protein  32.31 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>