25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3506 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3506  DoxX  100 
 
 		 72 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  75 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  65.67 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  60 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  77.27 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  62.9 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  45.59 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  64.52 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  43.94 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  61.02 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  45.31 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  45.31 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  45.31 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  44.12 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  44.44 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  42.86 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  40.3 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  59.68 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  50 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  47.06 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  47.54 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  38.1 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  37.7 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  38.1 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  38.1 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>