57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5807 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  94.56 
 
 		 148 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  91.72 
 
 		 148 aa  265  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  92.91 
 
 		 148 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  76.55 
 
 		 150 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  75.86 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  75.86 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  75 
 
 		 151 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  57.75 
 
 		 216 aa  166  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  62.5 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  51.88 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  47.54 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  47.22 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  48.11 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  37.12 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  44.36 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  40.37 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  33.33 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  31.25 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  44.9 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  34.43 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  31.01 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  38.39 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  32.03 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  28.03 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  27.2 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  45.59 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  33 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  25.62 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  26.45 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  28.7 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  30.7 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  26.45 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  29.7 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  27.27 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  27.72 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  27.72 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  27.72 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  30.56 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  23.33 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  26.45 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  31.25 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  27.62 
 
 		 149 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  26.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  31.76 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  25.44 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  25.44 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  25.23 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  23.42 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  25.44 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  25.44 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  25.44 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  26.72 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  25.44 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  25.44 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  25.23 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  25.44 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>