66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0893 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  96.62 
 
 		 148 aa  282  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  58.39 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  56.83 
 
 		 141 aa  139  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  45.38 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  44.8 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  31.3 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  35.61 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  39.1 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  34.65 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  41.8 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  34.4 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  30.4 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  30.4 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  30.4 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  28.03 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  27.2 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  34.69 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  27.2 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  25 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  35.19 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  30.56 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  35.71 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  33.67 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  28.78 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  28.78 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  29.1 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  38.38 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  27.66 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  31.75 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.96 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  30.77 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  29.69 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  28.83 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  27.34 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  33.06 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  29.2 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  28.91 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  31.48 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  26.98 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  35.14 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  30.95 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  35.59 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  36.61 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  28.03 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  28.35 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  30.83 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  30.28 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  32.41 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  29.03 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  31.3 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  25.78 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  27.74 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  29.13 
 
 		 155 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  26.62 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  26.89 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  29.2 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  29.84 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  29.01 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  29.75 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  33.33 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  28.33 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  28.33 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  28.33 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>