55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1555 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  100 
 
 		 151 aa  296  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  56.46 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  59.44 
 
 		 183 aa  156  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  62.5 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  72.22 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  56.25 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  72.12 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  59.66 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  77.27 
 
 		 72 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  48.65 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  45.45 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  47.45 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  47.45 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  45.99 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  44.36 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  42.86 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  43.94 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  50 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  43.31 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  49.21 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  41.22 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  35.83 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  36.61 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  35.9 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  38.05 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  35.35 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  36.89 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  34.38 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  34.38 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  30.93 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.75 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  39.81 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  38.94 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  35.45 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  33.91 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  30.93 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  31.15 
 
 		 250 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  35.87 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  35.87 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  35.87 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  33.33 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  31.71 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  28.21 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  34.62 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  33.7 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  30.89 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  33.8 
 
 		 182 aa  43.9  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  28.21 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  36.11 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  27.97 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  28.81 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  33.33 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  31.13 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  28.18 
 
 		 139 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>