50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1140 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  265  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  58.39 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  58.39 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  54.68 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  37.96 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  40.46 
 
 		 137 aa  85.9  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  41.18 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  38.76 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  41.96 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  36.59 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  35.77 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  31.85 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  41.96 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  31.85 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  32.59 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  32.59 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  30.37 
 
 		 148 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  31.01 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  33.33 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  41.22 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  39.58 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  34.43 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  34.51 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  38.94 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  29.84 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  35.19 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  33.93 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  30.83 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  36.59 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  34.82 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  30.91 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  33.04 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  33.33 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  31.19 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  34.96 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  33.33 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  33.61 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  33.61 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  28.1 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  31.53 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  30.63 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  34.19 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.76 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  32.76 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  32.71 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  27.19 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  31.36 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  31.37 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  32.77 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>