58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0761 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  100 
 
 		 132 aa  257  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  62.81 
 
 		 183 aa  142  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  63.11 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  64.96 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  50.85 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  59.66 
 
 		 151 aa  106  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  64.76 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  50.82 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  43.48 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  41.23 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  38.93 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  40.17 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  40.17 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  40.17 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  34.43 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  35.25 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  34.4 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  34.82 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  34.19 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  59.68 
 
 		 72 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  40.54 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  34.51 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  36.21 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  33.04 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  33.04 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  32.63 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  32.35 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  27.27 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  32.38 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  34.62 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  33.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  32.38 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  26.96 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  27.27 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  29.17 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  31.13 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  33.06 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  31.07 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  34 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.7 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  32 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  33.33 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3431  DoxX family protein  35.64 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  27.42 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  24.79 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  32 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  24.81 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1546  DoxX family protein  33.33 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  27.84 
 
 		 142 aa  42  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  32 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  29.91 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  30.11 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  31.71 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  27.66 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  24.17 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  30.37 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>