70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1718 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  100 
 
 		 141 aa  277  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  59.7 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  58.96 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  54.68 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  41.27 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  36.64 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  34.35 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  37.78 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  33.09 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  33.09 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  32.85 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  31.88 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  34.29 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  33.33 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  33.33 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  34.51 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  36.57 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  36.64 
 
 		 250 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  41.26 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.58 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  33.61 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  30.4 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  33.93 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  31.45 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  33.87 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  29.77 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  29.77 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  33.1 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  32.12 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  31.67 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  32.23 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  29.29 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  34.34 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  28.23 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  32.2 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.6 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  29.75 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  28.45 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  33.07 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  28.36 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  30.43 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30.77 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  26.72 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.35 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  31.46 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  33.33 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  31.78 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  30.65 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  29.03 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  29.17 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  28.36 
 
 		 321 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  28.36 
 
 		 321 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  28.36 
 
 		 321 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  27.94 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  27.1 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  29.75 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  30.08 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  31.25 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  29.91 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  30.28 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  25.47 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  31.03 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  29.82 
 
 		 131 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  29.82 
 
 		 131 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  26.92 
 
 		 151 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  29.82 
 
 		 131 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>