177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2074 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  100 
 
 
145 aa  285  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1426  DoxD-like family protein  91.03 
 
 
145 aa  243  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2188  DoxD-like family protein  91.03 
 
 
145 aa  243  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39427  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0561  DoxX family membrane protein  91.03 
 
 
145 aa  243  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0464  DoxX family protein  91.03 
 
 
145 aa  243  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.412831  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0873  DoxD-like family protein  91.03 
 
 
145 aa  243  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1877  hypothetical protein  90.34 
 
 
145 aa  240  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  76.55 
 
 
145 aa  213  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  75.86 
 
 
145 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  75.17 
 
 
145 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  76.55 
 
 
145 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  71.11 
 
 
152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  66.2 
 
 
143 aa  197  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  73.1 
 
 
145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  73.1 
 
 
145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  73.1 
 
 
145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  67.13 
 
 
145 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  47.33 
 
 
137 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  46.27 
 
 
137 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  43.08 
 
 
140 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  43.2 
 
 
137 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  42.4 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  40.62 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  40.62 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  40.62 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  40.62 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  40.62 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  40.32 
 
 
164 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  40.32 
 
 
164 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  40.15 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  39.23 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  43.7 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  42.86 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  44.54 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  42.15 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  42.4 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  38.4 
 
 
129 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  41.59 
 
 
137 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  41.18 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  42.19 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  42.15 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  37.72 
 
 
182 aa  84.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  39.47 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  39.47 
 
 
174 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  43.7 
 
 
136 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  40.35 
 
 
174 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  39.23 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  38.66 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  38.17 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  34.96 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  39.82 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  39.82 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  39.82 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  41.09 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  38.94 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  36.57 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  38.52 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  33.33 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  36.89 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  34.56 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  35 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  45.63 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  39.37 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  33.08 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  34.56 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  38.6 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  38.6 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  38.35 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  40.35 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  38.35 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  38.6 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  40.35 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  38.6 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  38.35 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  38.35 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  36.84 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  36.84 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  36.84 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  36.84 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  36.84 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  36.84 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  36.84 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  36.03 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  37.59 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  45.45 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  39.47 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  34.86 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  37.88 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  36.09 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  36.61 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  33.87 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  33.61 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  32.06 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  36.84 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  36.84 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  36.84 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  35.61 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  34.68 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  39.52 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>