77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3877 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  295  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  54.61 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  55.63 
 
 		 152 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  54.17 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  51.32 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  51.54 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  42.55 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  27.54 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  29.66 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  30.28 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  30.28 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  27.14 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  29.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  36.96 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  29.86 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  28.77 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  26.81 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  30.28 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  28.06 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  30.99 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  28.06 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  29.71 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  28.17 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  27.54 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  28.26 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  28.97 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  30.83 
 
 		 379 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  28.97 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  28.97 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  28.97 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  28.97 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  28.97 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  28.97 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  28.97 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  30.53 
 
 		 271 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  27.54 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  35.42 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  29.73 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  29.5 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.66 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  35.42 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  29.79 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  29.25 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  26.24 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  29.5 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  27.97 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4176  DoxX family protein  46.94 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  34.38 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  28.78 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  30 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  30.66 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  30.83 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  25.9 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3329  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  27.54 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  31.36 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  28.87 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  28.57 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  29.21 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  28.57 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  28.57 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  25.2 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  24.65 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  28.35 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  26.72 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  28.78 
 
 		 136 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  27.82 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  31.87 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  29.55 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  31.87 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  31.87 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  31.87 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  26.52 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  31.87 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  31.87 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  28.57 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  31.87 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>