45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1274 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  93.92 
 
 		 148 aa  275  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  92.91 
 
 		 148 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  89.12 
 
 		 148 aa  261  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  80.95 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  80.95 
 
 		 150 aa  217  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  80.95 
 
 		 150 aa  217  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  74.66 
 
 		 151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  61.15 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  61.24 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  52.63 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  43.65 
 
 		 183 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  47.52 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  43.9 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  38.21 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  41.67 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  31.65 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  34.35 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  37.61 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  30.83 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  43.56 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  30.37 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  34.19 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  35.96 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  27.2 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  27.2 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  25.21 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  31.78 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  32.41 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  28.24 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  42.86 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  25.21 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  27.48 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  25.21 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  27.72 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  30.84 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  26.85 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  25.74 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  25.74 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  25.74 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  31.58 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  26.67 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  23.81 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  25 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  24.35 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>