34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1669 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  59.23 
 
 		 183 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  57.04 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  56.46 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  57.81 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  51.05 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  50.85 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  40.65 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  41.03 
 
 		 216 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  58.65 
 
 		 140 aa  84.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  60 
 
 		 72 aa  84.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  39.69 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  38.21 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  38.97 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  37.12 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  41.46 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  38.03 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  38.69 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  38.69 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  36.59 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  36.97 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  29.84 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  35.51 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  32.54 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  29.1 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  29.1 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  34.43 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.42 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  31.91 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  28.42 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  28.42 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  31.91 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  26.21 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  28.16 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>