54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5591 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  94.56 
 
 		 148 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  92.52 
 
 		 148 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  89.12 
 
 		 148 aa  261  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  76.87 
 
 		 150 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  76.87 
 
 		 150 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  76.87 
 
 		 150 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  75.34 
 
 		 151 aa  196  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  59.29 
 
 		 216 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  60.94 
 
 		 141 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  52.63 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  44.53 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  45.37 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  42.86 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  47.17 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  36.97 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  40.37 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  31.88 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  31.25 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  32.56 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  35.25 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  43.88 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  38.39 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  32.03 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  26.77 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  43.94 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  25.23 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  30.97 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  27.78 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  25.23 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  28.71 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  25.23 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  27.27 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  30.83 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  25.23 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  26.45 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  24.17 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  26.73 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  26.73 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  26.73 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  26.55 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  27.62 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  26.55 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  31.25 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  26.55 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  26.55 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  27.1 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  26.55 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  26.55 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  26.55 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  26.55 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  26.67 
 
 		 137 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>