58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4847 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  100 
 
 		 144 aa  283  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  75.81 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  67.52 
 
 		 183 aa  155  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  51.05 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  79.66 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  62.5 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  65.79 
 
 		 132 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  51.56 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  47.48 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  47.11 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  47.15 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  47.11 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  50 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  43.9 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  48.11 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  46.36 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  44.26 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  46.02 
 
 		 216 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  41.91 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  47.17 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  65.67 
 
 		 72 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  34.48 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  34.82 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.55 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  35.45 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  35.59 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  36.27 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  30.7 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  30.43 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  31.63 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  31.25 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  32.65 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  32.65 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  43.14 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  26.79 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  34.69 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  41.18 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  32.76 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  27.93 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  28.57 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  38.61 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  35.05 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  28.97 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  28.57 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  28.57 
 
 		 164 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  28.57 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  28.57 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  33.33 
 
 		 174 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  27.5 
 
 		 137 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  28.57 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  31.03 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  35.62 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  30 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  26.42 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>