33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2393 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  100 
 
 		 141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  58.96 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  59.56 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  52.63 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  52.63 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  52.63 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  57.04 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  57.04 
 
 		 150 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  51.88 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  57.04 
 
 		 150 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  54.41 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  50.46 
 
 		 183 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  40.65 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  54.08 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  45.45 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  37.12 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  43.93 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  41.91 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  35.61 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  40.77 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  43.52 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  33.59 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  38.93 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  33.33 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  34.06 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  31.67 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  40.3 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  25.98 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  32.11 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30.83 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  32.99 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  29.17 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>