39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1273 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  100 
 
 		 183 aa  361  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  69.23 
 
 		 131 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  59.23 
 
 		 147 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  67.52 
 
 		 144 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  59.44 
 
 		 151 aa  135  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  62.1 
 
 		 132 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  60.33 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  66.99 
 
 		 140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  51.64 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  47.54 
 
 		 148 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  44.53 
 
 		 148 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  50.46 
 
 		 141 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  45.24 
 
 		 148 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  48.03 
 
 		 150 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  51.82 
 
 		 141 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  48.03 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  48.03 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  48.15 
 
 		 216 aa  95.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  43.65 
 
 		 148 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  46.55 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  62.9 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  41.96 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  36.11 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  36.08 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  32.48 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  33.33 
 
 		 131 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  31.85 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  29.09 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  33.61 
 
 		 141 aa  47.8  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  34.86 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  32.67 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  29.17 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  27.83 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  33.93 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  27.61 
 
 		 136 aa  42  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  30.21 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0493  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.71 
 
 		 419 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0943548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>