34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5593 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  275  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  58.96 
 
 		 216 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  59.56 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  64.34 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  62.5 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  60.47 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  63.57 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  60.94 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  61.24 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  63.57 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  61.83 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  51.82 
 
 		 183 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  48.65 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  39.69 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  44.07 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  48.98 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  44.26 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  34.59 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  36.64 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  34.65 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  46.49 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  41.23 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  35.38 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  44.36 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  36.57 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  30.28 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  30.28 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  26.36 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  32.43 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  47.06 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  28.43 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  28.43 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  28.43 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>