34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4613 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  100 
 
 		 159 aa  314  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  43.75 
 
 		 250 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  43.41 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  39.85 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  45.38 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  37.96 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  41.27 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  38.52 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  36.64 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  31.65 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  33.09 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  33.59 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  31.78 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  31.25 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  30.99 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  30.99 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  31.25 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  31.25 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  30.99 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  35.79 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  36.11 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.21 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  32.54 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  34.48 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  34.74 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  34.17 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  26.03 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  26.45 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.83 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  29.75 
 
 		 132 aa  44.3  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  30.36 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  31.71 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  30.36 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>