123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2498 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2498  DoxX  100 
 
 		 149 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  85.33 
 
 		 150 aa  256  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  68.97 
 
 		 152 aa  200  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  71.76 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  64.14 
 
 		 150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  51.32 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  33.83 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  32.85 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  35.25 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  32.85 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  31.65 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30.22 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4176  DoxX family protein  39.13 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  34.09 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  30.77 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  32.12 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  31.47 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.82 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  33.81 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  31.88 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.59 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  39.29 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  33.58 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  36.05 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  32.48 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  36.67 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.62 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  28.57 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  30.6 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  30.77 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  32.06 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  37.59 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  39.53 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  32.84 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  36.9 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  36.9 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  41.67 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  29.85 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  27.14 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  28.03 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  30.08 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  30.23 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  29.73 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  34.52 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  27.74 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  27.66 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  30.83 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  30.77 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  28.67 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  31.62 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  31.11 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  28.06 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  32.12 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  25.76 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3329  hypothetical protein  28.24 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  39.44 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  28.68 
 
 		 271 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  26.36 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  27.82 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  28.38 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  28.36 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  29.76 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  28.91 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  28.91 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  28.91 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  28.91 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  28.91 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  28.91 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  28.91 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  28.91 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  29.76 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  33.72 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  36.9 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  36.9 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  33.72 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  33.72 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  33.72 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  30.95 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  35.71 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  36.9 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  27.69 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  30.71 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  28.21 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  33.72 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  29.46 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  33.72 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  27.07 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  33.72 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  26.12 
 
 		 315 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  30.69 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  34.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  34.52 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  30.25 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  26.47 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  35.38 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>