55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2564 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  100 
 
 
137 aa  265  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  57.35 
 
 
149 aa  153  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  50.39 
 
 
138 aa  128  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  48.55 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1422  DoxX family protein  57.25 
 
 
149 aa  100  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  39.62 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  36.36 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  36.19 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  37.27 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  36.36 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  29.51 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  29.7 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  28.69 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  31.9 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  27.27 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3737  DoxX family protein  30.53 
 
 
175 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  30.51 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  31.97 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  42.06 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  31.36 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  29.32 
 
 
236 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0081  DoxX family protein  32.99 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.614954  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  33.96 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  28.21 
 
 
137 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  27.82 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3522  DoxX family protein  25.26 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0254213  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  31.97 
 
 
136 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  33.94 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  28.12 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  32.38 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  29.17 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  26.72 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  29.37 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  27.59 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  26.72 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  35.59 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  26.56 
 
 
379 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  35.9 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2136  DoxX family protein  30.69 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  25.44 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  27.27 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  28.7 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  28.57 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  27.03 
 
 
142 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  31.52 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3227  DoxX family protein  26.67 
 
 
125 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374067  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3329  hypothetical protein  26.92 
 
 
129 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  28.7 
 
 
142 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  30.63 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  27.38 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  28.3 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  25.44 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1107  DoxX family protein  30.68 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  41.46 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  29.06 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>