47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2251 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  100 
 
 
146 aa  280  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  49.66 
 
 
149 aa  137  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  52.63 
 
 
138 aa  124  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1422  DoxX family protein  64.14 
 
 
149 aa  123  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  48.55 
 
 
137 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  38.46 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  40.4 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  39.66 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  34.95 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  33.64 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  39.81 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  33.64 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  33.72 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  34.62 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  27.73 
 
 
379 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  32.77 
 
 
236 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  27.86 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  39.06 
 
 
182 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  31.67 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  34.75 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  28.46 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  28.57 
 
 
143 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  32.48 
 
 
137 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  33.72 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  27.69 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.46 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  42.73 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  31.45 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  29.51 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  34.44 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  32.53 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  33.03 
 
 
178 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  32.14 
 
 
226 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  29.52 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  30.89 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  30.77 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  27.12 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  26.02 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  29.55 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  32.11 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  32.11 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  32.11 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  31.88 
 
 
238 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  31.54 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  26.02 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  27.42 
 
 
135 aa  40  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  31.15 
 
 
143 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>