59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3329 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  100 
 
 		 134 aa  260  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  64.39 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  51.47 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  56.76 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  53.68 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  40.19 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  33.85 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  41.18 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  38.46 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  37.84 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  35.9 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  34.95 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.03 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1786  DoxX family protein  39.05 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  31.9 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  36.04 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  33.59 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1986  DoxX family protein  38.1 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  32.17 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  34.91 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  32.56 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  30.84 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  30.09 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  30.51 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  30.36 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  32.73 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  32.73 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  29.73 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  27.72 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  30.08 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  29.25 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  31.03 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  31.78 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  30.7 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  30.7 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  32.53 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  33.9 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  31.54 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  44.07 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  27.35 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  29.06 
 
 		 119 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  31.36 
 
 		 129 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  27.78 
 
 		 133 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  29.73 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  33.94 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  38.1 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  35.14 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  25.93 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  40.24 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  37.35 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  34.26 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30674  predicted protein  30.41 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00120467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  40.24 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16061  hypothetical protein  31.33 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  32.31 
 
 		 150 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>