87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4104 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  100 
 
 		 138 aa  268  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  56.72 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  47.06 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  49.63 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  48.74 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  57.01 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  43.36 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  40.19 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  42.72 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  41.46 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  34.82 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  36.36 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  35.29 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  33.04 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  32.46 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  34.21 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  34.21 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  33.04 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  35.96 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  32.43 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  31.78 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  29.57 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  32.17 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.14 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  30.63 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  30.09 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  36.19 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  36.04 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  34.83 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  28.7 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.78 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  29.82 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  28.83 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  36.28 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  37.31 
 
 		 379 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  28.7 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  37.88 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  38.81 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  38.81 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  28.7 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3227  DoxX family protein  30 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  38.83 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  33.33 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  30.97 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  28.91 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  30.97 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1422  DoxX family protein  44.19 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  31.34 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  28.07 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  27.83 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  29.69 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  27.83 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.57 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30674  predicted protein  32.64 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00120467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  38.1 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  26.12 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  35.34 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  31.82 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  31.19 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  34.23 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  29.73 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  29.6 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  32.74 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  37.68 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  29.69 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  38.33 
 
 		 315 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  26.02 
 
 		 238 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  36.67 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  29.77 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3522  DoxX family protein  29 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0254213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  30.25 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1486  hypothetical protein  28.44 
 
 		 126 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0281989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  26.09 
 
 		 140 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  27.78 
 
 		 152 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  28.45 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  29.36 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  34.21 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  31.9 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15881  hypothetical protein  26.83 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111902  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  35.82 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  29.36 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  28.4 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12531  hypothetical protein  26.13 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  32.58 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  28.21 
 
 		 150 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  35.42 
 
 		 145 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>