31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12531 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_12531  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  51.35 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  49.58 
 
 
126 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16061  hypothetical protein  50.88 
 
 
123 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15881  hypothetical protein  50.94 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111902  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1486  hypothetical protein  49.52 
 
 
126 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0281989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1560  hypothetical protein  45.53 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.243689  normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0936  hypothetical protein  46.32 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17931  hypothetical protein  45.26 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.870563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  37.72 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  32.69 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  31.65 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  34.26 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.48 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  30.43 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  30.94 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  34.62 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  31.2 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  32.11 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  33.04 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  30 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  32.04 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  32.1 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  29.81 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  29.2 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  29.1 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  33.01 
 
 
128 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  32.71 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  27.62 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  27.1 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  27.78 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>