91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2081 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  100 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  54.81 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  60.45 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  63.91 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  56.3 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  37.38 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  36.43 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  36.92 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  35.88 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  36.61 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  34.78 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  34.23 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  36.52 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  33.91 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  34.21 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  34.95 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  33.04 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  32.46 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  32.17 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  31.3 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  33.94 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  33.04 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  33.33 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  32.14 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  38.94 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.3 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  31.09 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  31.97 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  25.89 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  35.77 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  29.57 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  29.2 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  38.6 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  31.4 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  44.26 
 
 		 379 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  33.63 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  29.92 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  30.71 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  32.76 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  31.82 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  34.48 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  32.67 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  29.91 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0936  hypothetical protein  29.76 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  30.91 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.31 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  35.78 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17931  hypothetical protein  29.76 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.870563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  29.36 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  28.04 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  28.04 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  29.82 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  28.71 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  36.19 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12531  hypothetical protein  28.18 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  28.57 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15881  hypothetical protein  26.83 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111902  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  28.4 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  34.48 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  38.24 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  30.3 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  31.78 
 
 		 137 aa  43.9  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  30.63 
 
 		 129 aa  43.9  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  30.58 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  35.23 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  30.47 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16061  hypothetical protein  30.49 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  39.71 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  30.89 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  39.71 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  32.2 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  39.71 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  25.22 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  26.55 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  25.22 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  35.8 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  35.51 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  32.14 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3519  DoxX family protein  32.14 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  30.63 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3431  DoxX family protein  41.07 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  33.94 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  33.77 
 
 		 315 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  32.76 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  30.65 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  32.1 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  32.76 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1486  hypothetical protein  27.16 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0281989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  30.77 
 
 		 131 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>