73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2379 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  100 
 
 
121 aa  238  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  48.76 
 
 
139 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  46.09 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  43.27 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  37.74 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  38.74 
 
 
136 aa  76.6  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  38.83 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  39.17 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  40.19 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  35.71 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  48.74 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  33.33 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  32.43 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  34.51 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  31.25 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  30.77 
 
 
174 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  40 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1422  DoxX family protein  43.18 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  37.39 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  30.09 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  35.29 
 
 
379 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  32.17 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  32.5 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  28.32 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  32 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  30.91 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  27.83 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  30.17 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  35.58 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  27.52 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  27.52 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  26.96 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  27.83 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  30.95 
 
 
271 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  27.83 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  32.73 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  29.91 
 
 
135 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  35.45 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  27.61 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  24.35 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0504  DoxX family protein  33.94 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  30.77 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30.28 
 
 
134 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  30.97 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  33.9 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  31.19 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  30.63 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  28.71 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  30 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  26.96 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  26.09 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  34.78 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  33.63 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  27.18 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  27.18 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  28.32 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  39.68 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  26.61 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  32.74 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  27.18 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  28.32 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  24.41 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  29.63 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  27.83 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  34.26 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  30 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  27.18 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  36.36 
 
 
238 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  27.5 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  30.86 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  30.95 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  25.4 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>