26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1486 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1486  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  246  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0281989  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  81.6 
 
 
126 aa  207  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15881  hypothetical protein  79.2 
 
 
126 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111902  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16061  hypothetical protein  54.05 
 
 
123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  47.27 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12531  hypothetical protein  49.52 
 
 
143 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0936  hypothetical protein  53.92 
 
 
133 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17931  hypothetical protein  53.92 
 
 
133 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.870563  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1560  hypothetical protein  46.9 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.243689  normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  34.68 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  38.39 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  34.21 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  35.11 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  34.26 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.03 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  42.06 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  35 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  30.58 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  30.58 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  27.83 
 
 
136 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  31.13 
 
 
128 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  32.35 
 
 
135 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  29.37 
 
 
139 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  34.31 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  28.91 
 
 
137 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>