34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0936 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0936  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  257  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17931  hypothetical protein  98.5 
 
 		 133 aa  254  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.870563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16061  hypothetical protein  53.1 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15881  hypothetical protein  55.24 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111902  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1486  hypothetical protein  54.95 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0281989  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  54.81 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12531  hypothetical protein  41.79 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  41.98 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1560  hypothetical protein  40.65 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.243689  normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  32.62 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  38.68 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  35.29 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  36.78 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  30.08 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  32.74 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  28.18 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  31.68 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  35.37 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  36.67 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  34.34 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  29.76 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30.28 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  36.59 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  31.62 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  28.89 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  31.73 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  37.35 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  31.63 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  30.61 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  32.5 
 
 		 136 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  31.63 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  37.35 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  29.27 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>