178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0630 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  100 
 
 		 140 aa  276  9e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  40.88 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  38.21 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  35.82 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  36.67 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  38.06 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  36.88 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  36.13 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  40.18 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  44.92 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  31.78 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  34.92 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  37.17 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  30.88 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  39.42 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  40.68 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  36.69 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.33 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  30.58 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16061  hypothetical protein  40.91 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  31.71 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  34.59 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  30.58 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  31.25 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  32.33 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  33.87 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  35.61 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  34.62 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  29.25 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  30.36 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  29.69 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  36 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  32.82 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  30.09 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  35.58 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  38.69 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  28.57 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  28.91 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  31.9 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1486  hypothetical protein  34.68 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0281989  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  33.96 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  31.78 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  36.92 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12531  hypothetical protein  37.72 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  32.8 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  31.88 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  39.69 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  35.29 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  34.53 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  28.21 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  41.86 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  32.41 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  33.02 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  34.85 
 
 		 379 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  33.02 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  31.97 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  31.45 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  30 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.27 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  31.4 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  34.85 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3563  DoxX family protein  39.53 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1654  normal  0.902228 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15881  hypothetical protein  35.56 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  33.87 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  32.56 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  33.02 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  33.58 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  32.71 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  28.57 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  33.33 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  30.36 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  33.33 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  33.33 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  30.36 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  30.36 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17931  hypothetical protein  32.62 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.870563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  32.08 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  27.34 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  33.68 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  36.36 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0936  hypothetical protein  37.78 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  29.52 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  28.91 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  28.91 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  31.62 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  28.91 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  28.91 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  28.91 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  28.91 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  28.91 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  36.96 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  28.91 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  34.58 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  34.58 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  29.52 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  34.58 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  34.58 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  34.58 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  34.58 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>