173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3973 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  100 
 
 
135 aa  262  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  48.03 
 
 
136 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  60 
 
 
130 aa  121  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  44.27 
 
 
132 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  47.2 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  41.67 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  38.84 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  40.87 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  42.74 
 
 
128 aa  94  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  45.53 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  36.59 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  41.86 
 
 
161 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  41.86 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  41.86 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  41.86 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  41.6 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  39.2 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  40.31 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  41.09 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  41.32 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  42.74 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  41.13 
 
 
131 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  41.13 
 
 
131 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  41.13 
 
 
131 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  38.76 
 
 
160 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  38.76 
 
 
160 aa  84  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  38.76 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  38.76 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  38.76 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  38.76 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  39.1 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  38.76 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  37.98 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  37.98 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  40 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  39.68 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  35.56 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  39.84 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  40 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  37.88 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  37.88 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  40.91 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  37.6 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3563  DoxX family protein  46.67 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1654  normal  0.902228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  35.11 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  42.34 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  42.34 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  39.02 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  38.17 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  41.44 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  37.5 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  37.1 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3393  DoxX family protein  41.94 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  37.61 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3519  DoxX family protein  40.32 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  38.33 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3474  DoxX family protein  40.94 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.418038 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  36.07 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  36.59 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  36.07 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0520  DoxX family protein  39.52 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  34.15 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0738  DoxX family protein  38.71 
 
 
131 aa  67  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  37.6 
 
 
137 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  37.07 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  34.68 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0708  DoxX  35.43 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.277979  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15881  hypothetical protein  39.29 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 
164 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  36.04 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  39.29 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  32.33 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  33.33 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  31.97 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  33.33 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  33.33 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  34.43 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  33.33 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  37.5 
 
 
182 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  35.48 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  35.96 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0936  hypothetical protein  41.38 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12531  hypothetical protein  30.94 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3431  DoxX family protein  35.34 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  37.3 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  37.39 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  36.13 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1560  hypothetical protein  41.27 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.243689  normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17931  hypothetical protein  41.38 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.870563  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  35.71 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  36.59 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  33.83 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  33.66 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3217  DoxX family protein  37.4 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160219 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  33.33 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  33.33 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>