174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1200 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  66.17 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  49.55 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  43.97 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  39.71 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  38.6 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  38.79 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  41.74 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  36.7 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  43.9 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  37.74 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  38.74 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  42.73 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  39.84 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  37.17 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  38.89 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  34.82 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  42.73 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.23 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  34.86 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  35.51 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  34.86 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  42.24 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  34.86 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  33.33 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  35.14 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  35.04 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  34.26 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  34.26 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  37.84 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  30.25 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  38.53 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  36.36 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  36.73 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  40.54 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  34.23 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  34.34 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  36.89 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  32.71 
 
 		 182 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  34.23 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  37.5 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  33.62 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  32.74 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  33.96 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  30.15 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  33.06 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  28.78 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  30.15 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  30.84 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  32.71 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  36.45 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  32.71 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  37.07 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  30.48 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  33.08 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  36.21 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  33.33 
 
 		 379 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  30.84 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  32.35 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  33.03 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  28.57 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  32.35 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  32.35 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  36.46 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  26.45 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  32.67 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  30.95 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  31.19 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  34.86 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  33.33 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.19 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  33.64 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  33.64 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  27.14 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3474  DoxX family protein  38.21 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  29.32 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  33.64 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  34.34 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  29.37 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  29.82 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  33.64 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  33.64 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  33.64 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  33.64 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  32 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  33.66 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  25.71 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0708  DoxX  36.97 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.277979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  32.73 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  34.69 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  34.69 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  32.73 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3217  DoxX family protein  40.35 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  34.55 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  34.69 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  32.73 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  31.67 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  31.67 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  29.73 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>