155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2645 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2645  DoxX  100 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  60 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  45.6 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  44.8 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  47.58 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  46.03 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  45.16 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  45.16 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  45.16 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  45.16 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  45.45 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  43.55 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  44.09 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  41.94 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  41.94 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  41.94 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  41.94 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  41.94 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  41.94 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  41.94 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  41.13 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  41.13 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  43.2 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  39.2 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  39.2 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  39.2 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  42.86 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0520  DoxX family protein  44 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3563  DoxX family protein  46.55 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1654  normal  0.902228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3393  DoxX family protein  42.4 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0738  DoxX family protein  44 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  40.48 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  43.36 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3519  DoxX family protein  41.6 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  42.48 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  42.48 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  40 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.61 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  36.97 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  35.61 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  34.88 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  35.25 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  36 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  35.59 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  34.13 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  41.86 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  39.02 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  37.38 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  37.4 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  37.5 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  41.12 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  34.43 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  32.33 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16051  hypothetical protein  34.17 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3217  DoxX family protein  39.37 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160219 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  36.13 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  34.88 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  35.34 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  32.12 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1486  hypothetical protein  33.91 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0281989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  32.58 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12531  hypothetical protein  31.65 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  40.16 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16061  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  39.37 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  32.17 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  31.75 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  32.71 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  34.23 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  35.14 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3474  DoxX family protein  33.59 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3431  DoxX family protein  31.13 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  36.84 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  31.54 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  31.48 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  31.88 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  33.93 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  30.53 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  31.97 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11793  hypothetical protein  32.14 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  31.71 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  31.71 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.8 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  30.16 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  34.26 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0936  hypothetical protein  30.34 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  32.8 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  32.52 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  30.63 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  28.46 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  31.15 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17931  hypothetical protein  30.34 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.870563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3078  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  33.05 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  34.88 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>