209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0302 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  100 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  43.41 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  42.11 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  43.2 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  45.9 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  44.53 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  39.53 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  41.6 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  40 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  42.31 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  38.93 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  38.93 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  42.24 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  43.22 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  44.64 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  39.13 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  42.15 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  39.57 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  37.04 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3737  DoxX family protein  41.32 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  44.44 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  38.41 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  38.41 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  38.1 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  36.36 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  38.41 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  38.41 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  42.11 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  36.84 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  45.11 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  37.32 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  37.32 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  37.32 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  36.96 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  34.09 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  39.55 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  39.45 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  39.45 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  39.45 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  39.45 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  36.23 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  36.23 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  31.78 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  36.23 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  36.23 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  36.23 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  36.23 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  36.36 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  38.4 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  36.23 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  35.51 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  36 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  37.41 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  33.83 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  35.51 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  41.98 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  37.17 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  44 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  34.85 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  38.32 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  34.59 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  31.01 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  39.45 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3563  DoxX family protein  38.64 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1654  normal  0.902228 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  39.45 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  35.61 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  39.45 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  35.48 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  35.2 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  38.93 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  40.16 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  36.64 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  32.82 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  39.69 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  36 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0738  DoxX family protein  38.85 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  33.6 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0520  DoxX family protein  38.85 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  39.02 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  38.05 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  32.84 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  35.34 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  37.86 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  34.51 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  37.21 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  37.3 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  37.3 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  37.86 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  41.74 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  34.51 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  34.19 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4176  DoxX family protein  42.31 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  34.09 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  36.43 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  36.45 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  36.43 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  36.43 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  40.48 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  36.04 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  34.19 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>