183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4176 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4176  DoxX family protein  100 
 
 		 129 aa  246  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  85.27 
 
 		 129 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  42.62 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  38.76 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  42.22 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  39.13 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  41.54 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  38.4 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  38.4 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  37.3 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  38.4 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  38.4 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  38.4 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  38.4 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  38.4 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  38.4 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  37.6 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  34.65 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  39.42 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  41.8 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  35.43 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  35.43 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  34.65 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  39.06 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  33.07 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  42.31 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  34.65 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  41.13 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  34.65 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  37.8 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  34.38 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  35.16 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  34.13 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  36.57 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  38.52 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  34.65 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  30.95 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  36.15 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  39.34 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  35.4 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3563  DoxX family protein  40.65 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1654  normal  0.902228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  37.5 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  36.92 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  38.94 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5793  hypothetical protein  39.2 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  37.1 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  38.14 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  31.78 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  39.2 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  34.88 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  34.4 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  39.34 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  33.93 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  35.09 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  43.36 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  33.93 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  38.17 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  37.4 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.43 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  35.71 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  35.71 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  33.93 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  35.71 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  39.37 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  37.7 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  37.7 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  37.7 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  35.11 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  37.7 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  35.11 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  35.11 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  38.52 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  37.5 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  32.03 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  37.8 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  37.8 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  37.8 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  32.35 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  37.7 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  35.54 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  36.8 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  37.04 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  36.72 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  35.16 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  36.89 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  36.89 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  36.89 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  36.89 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  32.59 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  36.89 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  32.11 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  36.89 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  36.89 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  36.89 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  33.93 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  32.81 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  35.54 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0873  DoxD-like family protein  32.81 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>