100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3623 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  100 
 
 		 174 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3737  DoxX family protein  93.53 
 
 		 175 aa  249  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  85.89 
 
 		 175 aa  249  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0081  DoxX family protein  70.68 
 
 		 175 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.614954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2136  DoxX family protein  58.02 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1107  DoxX family protein  57.41 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298421  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  43.22 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  30.3 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  29.03 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  30.33 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  28.23 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  28.57 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  26.83 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  30.3 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  30.3 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.75 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  30.16 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  34.96 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  30.16 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  30.16 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  30.16 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  30.16 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  30.16 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  30.16 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  30.16 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  25 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  29.55 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  29.27 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.8 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  29.77 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  30.65 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  34.71 
 
 		 129 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  30.3 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  27.87 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  31.43 
 
 		 119 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  27.34 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  31.19 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  30.83 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  27.64 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  28.68 
 
 		 136 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  28.1 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  27.34 
 
 		 138 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  26.56 
 
 		 137 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  25.96 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  26.47 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  26.47 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  29.77 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  33.59 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  25 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  31.67 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  29.66 
 
 		 130 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  31.15 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  31.15 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  31.15 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  34.15 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  31.15 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  28.57 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  29.66 
 
 		 130 aa  45.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  24.51 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  24.51 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  24.51 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  28.57 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  29.41 
 
 		 130 aa  44.7  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  31.4 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  28.81 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  29.37 
 
 		 136 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  28.81 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  28.81 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  28.81 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  28.81 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  26.27 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  27.97 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  28.23 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  31.25 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  29.36 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  28.46 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  27.78 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  26.57 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  29.84 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  29.31 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  29.84 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  29.84 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  33.98 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  32.26 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  29.81 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  29.81 
 
 		 167 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3474  DoxX family protein  31.91 
 
 		 132 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  31.16 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  30.63 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  28.85 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  28.85 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  28.85 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  27.72 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  30.65 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  23.08 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  31.11 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  31.11 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  31.11 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>