83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3737 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3737  DoxX family protein  100 
 
 		 175 aa  327  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  98.86 
 
 		 175 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  89.7 
 
 		 174 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0081  DoxX family protein  69.7 
 
 		 175 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.614954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2136  DoxX family protein  56.92 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1107  DoxX family protein  54.63 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298421  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  42.37 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  29.6 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  30.33 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.56 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  35 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  26.61 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  28.03 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  28.12 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  30.3 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  30.3 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  31.2 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  34.35 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  35.54 
 
 		 129 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  29.55 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  29.69 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  29.69 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  29.69 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  24.81 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  29.69 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  29.69 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  29.69 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  29.69 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.57 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  29.69 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  28.68 
 
 		 143 aa  51.6  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  24.81 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  27.91 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  32.82 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  27.94 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  28.26 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  29.17 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  30.25 
 
 		 130 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  29.17 
 
 		 160 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  30.25 
 
 		 130 aa  47.8  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  30.3 
 
 		 137 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  30 
 
 		 130 aa  47.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  30.25 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  30.25 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  30.25 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  29.41 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  29.6 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  29.6 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  30.25 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  29.41 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  29.6 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  29.41 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  27.56 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  29.41 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  29.41 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  27.64 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  31.19 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  27.2 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  30.25 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  30.48 
 
 		 119 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  26.77 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  29.51 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  27.27 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  25.71 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  25.71 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  24.76 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  25.71 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  27.97 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  27.13 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3474  DoxX family protein  31.25 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  26.96 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  33.59 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  27.78 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  33.33 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  27.56 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  30.33 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  26.61 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  23.81 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  23.81 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  23.81 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  30.84 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  28.93 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  27.42 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>